Δεκατρία είναι τα νοσοκομεία αναφοράς τα οποία ορίστηκαν από το υπουργείο Υγείας για να υποδέχονται τα ύποπτα κρούσματα και να αντιμετωπίζουν τα επιβεβαιωμένα περιστατικά.
Όλα τα νοσοκομεία αναφοράς και τα πληρώματα των ασθενοφόρων ΕΚΑΒ και Υγειονομικών Περιφερειών έχουν επάρκεια σε γάντια, ειδικές μάσκες και στολές.
Τα νοσοκομεία είναι τα ακόλουθα:
- ΓΝ Νοσημάτων Θώρακος Αθηνών «Η Σωτηρία»,
- ΓΝ Αθηνών «Ο Ευαγγελισμός»
- Πανεπιστημιακό ΓΝ «Αττικόν»,
- ΓΝ Ελευσίνας «Θριάσιο»
- Πανεπιστημιακό ΓΝ Θεσσαλονίκης ΑΧΕΠΑ,
- Πανεπιστημιακό ΓΝ Αλεξανδρούπολης,
- ΓΝ Πτολεμαΐδας «Μποδοσάκειο»
- Πανεπιστημιακό ΓΝ Λάρισας,
- ΓΝ Λαμίας
- Βασικό: Πανεπιστημιακό ΓΝ Πατρών «Παναγιά η Βοήθεια»,
- Πανεπιστημιακό ΓΝ Ιωαννίνων
- Βασικό: Πανεπιστημιακό ΓΝ Ηρακλείου,
- ΓΝ Χανίων «Ο Άγιος Γεώργιος»